Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EYA3Q99504 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EYA3Q99504 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EYA3Q99504 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms