Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYCBPQ99417 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCBPQ99417 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYCBPQ99417 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms