Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK5RAP2Q96SN8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK5RAP2Q96SN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK5RAP2Q96SN8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK5RAP2Q96SN8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms