Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CICQ96RK0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CICQ96RK0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CICQ96RK0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CICQ96RK0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CICQ96RK0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms