Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF12Q96QT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF12Q96QT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms