Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LMTK3Q96Q04 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
LMTK3Q96Q04 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
LMTK3Q96Q04 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LMTK3Q96Q04 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms