Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
GBP4Q96PP9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GBP4Q96PP9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms