Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCLT1Q96NL6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCLT1Q96NL6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms