Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP57Q96MR6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP57Q96MR6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP57Q96MR6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP57Q96MR6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms