Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM20AQ96MK3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM20AQ96MK3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM20AQ96MK3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM20AQ96MK3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230 ms