Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCMTD1Q96MG8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PCMTD1Q96MG8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms