Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC7Q96M83 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCDC7Q96M83 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC7Q96M83 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms