Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALPK3Q96L96 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALPK3Q96L96 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALPK3Q96L96 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms