Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPTM1LQ96KA5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLPTM1LQ96KA5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms