Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LOXL4Q96JB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LOXL4Q96JB6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LOXL4Q96JB6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms