Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB1Q96FW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
OTUB1Q96FW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB1Q96FW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms