Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3IP1Q96FE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3IP1Q96FE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms