Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT2Q96EX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNFT2Q96EX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNFT2Q96EX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms