Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L3HYPDHQ96EM0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms