Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC58Q96CX6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC58Q96CX6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC58Q96CX6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC58Q96CX6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms