Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OPTNQ96CV9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPTNQ96CV9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OPTNQ96CV9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms