Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TLCD1Q96CP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLCD1Q96CP7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD1Q96CP7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms