Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ULK4Q96C45 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ULK4Q96C45 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ULK4Q96C45 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms