Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUBP1Q96AE4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FUBP1Q96AE4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FUBP1Q96AE4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms