Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C6Q969F1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C6Q969F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms