Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX13Q92968 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX13Q92968 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms