Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT35Q92764 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT35Q92764 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT35Q92764 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms