Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA1Q92743 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA1Q92743 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms