Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RUBCNQ92622 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUBCNQ92622 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUBCNQ92622 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUBCNQ92622 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms