Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SREK1Q8WXA9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SREK1Q8WXA9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms