Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCTD4Q8WVF5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCTD4Q8WVF5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD4Q8WVF5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms