Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF138Q8WVD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF138Q8WVD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF138Q8WVD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF138Q8WVD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF138Q8WVD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF138Q8WVD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF138Q8WVD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms