Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB2BQ8WUD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB2BQ8WUD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms