Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBAR1Q8TDU6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBAR1Q8TDU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms