Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA2Q8TDQ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA2Q8TDQ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA2Q8TDQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA2Q8TDQ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA2Q8TDQ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms