Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMC1Q8TDI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TMC1Q8TDI8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TMC1Q8TDI8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TMC1Q8TDI8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms