Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM71BQ8TC56 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM71BQ8TC56 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM71BQ8TC56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms