Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXO27Q8NI29 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO27Q8NI29 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO27Q8NI29 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms