Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF548Q8NEK5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF548Q8NEK5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF548Q8NEK5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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