Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG0

FAM71C, Protein FAM71C, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71CQ8NEG0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71CQ8NEG0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM71CQ8NEG0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71CQ8NEG0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms