Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF1Q8ND25 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF1Q8ND25 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF1Q8ND25 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms