Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RDH13Q8NBN7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RDH13Q8NBN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDH13Q8NBN7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RDH13Q8NBN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RDH13Q8NBN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms