Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP38Q8NB14 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP38Q8NB14 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms