Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNX2Q8N448 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LNX2Q8N448 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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