Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC47Q8N1G4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC47Q8N1G4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC47Q8N1G4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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