Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z2

ABRA, Actin-binding Rho-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAQ8N0Z2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABRAQ8N0Z2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABRAQ8N0Z2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABRAQ8N0Z2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABRAQ8N0Z2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABRAQ8N0Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABRAQ8N0Z2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABRAQ8N0Z2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABRAQ8N0Z2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms