Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMYD4Q8IYR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD4Q8IYR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms