Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM48Q8IWZ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM48Q8IWZ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms