Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKL3Q8IVW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL3Q8IVW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms