Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC6Q8IVU3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC6Q8IVU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC6Q8IVU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms